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Agents pathogènes : protozoaires de la famille des Eimeriidae, surtout Eimeria
Le genre Eimeria a été nommé en 1875 en l’honneur du zoologiste allemand Theodor Eimer, qui étudiait ces parasites. Eimeria tenella a été décrite chez le poulet en 1891, et en 1929 le pathologiste américain Ernest Tyzzer a distingué plusieurs espèces de coccidies des volailles. Les anticoccidiens sont utilisés depuis les années 1940, et des vaccins vivants sont apparus plus tard.
Chaque espèce animale a ses propres Eimeria, strictement spécifiques de l’hôte : sept espèces sont connues de longue date chez le poulet, les plus dangereuses étant E. tenella et E. necatrix, et trois autres ont été décrites en 2021. Les jeunes animaux sont les plus touchés, en particulier les poulets de chair dans leurs premières semaines. Les parasites détruisent la muqueuse intestinale et les oiseaux grossissent mal : la coccidiose est considérée comme l’une des maladies les plus coûteuses de l’aviculture mondiale.
La coccidiose est diagnostiquée d’après les signes cliniques, les lésions intestinales à l’autopsie et la coproscopie : les oocystes sont détectés et comptés dans les fientes par flottation. Les espèces d’Eimeria sont difficiles à distinguer d’après leurs oocystes. La PCR détecte l’ADN d’Eimeria dans les fientes, les organes et les aliments, et des PCR spécifiques d’espèce permettent d’identifier l’espèce avec précision.
Information de référence. Le diagnostic est posé par un vétérinaire sur la base des analyses de laboratoire.